Vivodyne nourrit l'IA de données biologiques humaines

Résumé

La biotech Vivodyne affirme que l’IA en découverte de médicaments manque de données humaines causales et mise sur ses labos robotiques HIVE pour combler ce déficit critique.

Les faits

Une startup de biotechnologie, Vivodyne, estime que l’industrie de la découverte de médicaments par IA souffre avant tout d’un problème de données et affirme avoir construit une machine pour y répondre. Ses laboratoires robotiques modulaires HIVE peuvent cultiver 20 types de tissus humains, les administrer en médicaments et les surveiller de manière autonome afin de générer des données biologiques causales, aujourd’hui majoritairement issues de tests sur les animaux ou d’études de cellules et de protéines isolées. Le débat sur la capacité de l’IA à « guérir le cancer » est vif. Le PDG d’Anthropic, Dario Amodei, souligne que ces promesses sont devenues plus clichés que crédibles, rappelant que « ce qui fonctionnera, c’est de guérir réellement le cancer ». Sam Altman a, de son côté, invoqué à plusieurs reprises la guérison du cancer pour justifier la course d’OpenAI vers l’AGI et la montée en puissance des capacités de calcul, tandis que Demis Hassabis, chez Google DeepMind, a estimé l’an dernier que l’IA pourrait potentiellement guérir toutes les maladies en une décennie. Pour l’instant, les résultats concrets restent modestes. Quelques médicaments conçus par IA sont entrés en essais cliniques sur l’humain, dont un arrivé jusqu’à la phase III de tests à large échelle, mais les obstacles ne sont pas tous à la portée des outils d’IA actuels. AlphaFold, récompensé par un prix Nobel pour ses avancées sur les briques élémentaires du vivant, n’a pas encore permis de mettre au point un nouveau médicament. Isomorphic Labs, fondé pour capitaliser sur AlphaFold, vise ses premiers essais — initialement prévus pour 2025 — d’ici la fin de cette année, en rappelant qu’une véritable découverte de médicaments exigera des modèles prédictifs très précis sur un vaste éventail de propriétés et d’interactions biochimiques. Vivodyne défend une approche différente. La société, issue de l’université de Pennsylvanie en 2021 après la thèse de doctorat en bio-ingénierie de son cofondateur et PDG Andrei Georgescu, affirme que ses tissus reproduisent de près le comportement d’organes humains réels. Elle indique que ses cellules hépatiques atteignent 94 % de précision prédictive par rapport à des essais cliniques humains en toxicité, que ses tissus des voies respiratoires correspondent au comportement de véritables tissus humains dans 96 % des cas, et que son modèle de moelle osseuse présente une concordance de 100 % dans des tests sur 20 médicaments de chimiothérapie. La société, qui a levé un peu moins de 80 millions de dollars au travers de deux tours menés par Khosla Ventures, a inauguré la semaine dernière ce qu’elle présente comme le plus grand « centre de données humaines » au monde, près de San Francisco, et Georgescu affirme que son équipe y atteint déjà un débit de tests deux fois supérieur à l’ensemble des essais sur animaux réalisés aux États-Unis.

Pourquoi c’est important

Vivodyne met l’accent sur un point souvent masqué par le discours technologique : la limite actuelle ne tient pas seulement aux modèles d’IA, mais à la nature des données biologiques utilisées pour les entraîner. En critiquant un champ qui repose encore largement sur des tests animaux et des « instantanés » cellulaires, la startup veut produire des données causales issues de tissus humains vivants, susceptibles de mieux refléter la complexité réelle de la physiologie humaine et des maladies. Si ses revendications de précision sur le foie, les voies respiratoires et la moelle osseuse se confirment à grande échelle, l’approche pourrait modifier la façon dont l’IA est utilisée en découverte de médicaments, en réduisant la dépendance aux modèles précliniques animaux et en améliorant le tri des candidats avant les essais cliniques coûteux. À plus long terme, la vision de Georgescu est de fournir les bases de modèles d’IA capables de maîtriser les relations de cause à effet dans la biologie humaine, condition nécessaire pour s’attaquer à des thérapies combinées et à des maladies complexes, bien au-delà des promesses abstraites de « guérison du cancer ».

Questions fréquentes

Quel problème Vivodyne veut-elle résoudre dans l’IA appliquée aux médicaments ?

Vivodyne estime que la découverte de médicaments par IA manque de données biologiques humaines causales et a construit des labos robotiques pour en produire.

Que font les laboratoires HIVE développés par Vivodyne ?

Les HIVE peuvent cultiver 20 types de tissus humains, les traiter de façon autonome et les surveiller afin de générer des données causales sur leurs réactions.

Quels résultats Vivodyne revendique sur ses modèles de tissus ?

La startup annonce 94 % de précision pour ses cellules hépatiques, 96 % de concordance pour ses tissus des voies respiratoires et 100 % pour sa moelle osseuse.

Combien Vivodyne a-t-elle levé et auprès de qui ?

Vivodyne indique avoir levé un peu moins de 80 millions de dollars au travers de deux tours de financement menés par Khosla Ventures.

Qu’est-ce que Vivodyne appelle un « centre de données humaines » ?

La société désigne ainsi un site près de San Francisco où ses labos HIVE généreraient un débit de tests deux fois supérieur à tous les essais sur animaux américains.

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